相較于本科畢業論文而言，碩士畢業論文是100%需要通過學術查重的，一般而言，各校關于碩士畢業論文的查重率規定雖有所不同，但基本上都規定查重率不得超過10%-20%，這也意味著碩士畢業論文的學術查重率必須要更為嚴格的控制。 學術VIP5.3系統雖然較之于以前的學術查重系統進行了升級，但是其重復率計算規則仍然是按照連續十三字符以上重復計算為重復部分，這也意味著學生可以巧妙的利用該規則避免重復。
碩士要求的重復率一般不會高于20％，如果大于或者等于20％，小于30％者，疑似存在學術不端行為，取消優秀學位論文評選資格，限期修改進行復檢。 初檢的重復率如果大于或等于30％，之后復檢大于或等于20％者，可能會被取消本次學位論文答辯資格。 結果在35％以上的同學，直接延期答辯，需要對論文重新進行修改。
中國學術通常會在每一年度收錄全國優秀的本科畢業論文納入大學生論文比對庫當中，在次年的PMLC查重系統的數據庫當中予以更新。 也就是說，一年之后，查重過的論文才會出現在對比庫里面。 而那時你早就離開學校了。 所以，大家在提前進行學術查重的時候，不要有所顧忌，中國學術論文查重后論文是不會被收錄的。
前面說了碩士論文的文獻是不包含在查重范圍內的，學術VIP查重會把論文中的文獻自動去除，所以不會算到正文查重上。 碩士要求的重復率一般不會高于20％，如果大于或者等于20％，小于30％者，疑似存在學術不端行為，取消優秀學位論文評選資格，限期修改進行復檢。 初檢的重復率如果大于或等于30％，之后復檢大于或等于20％者，可能會被取消本次學位論文答辯資格。
