第二條 本辦法所稱學術不端行為是指高等學校及其教學科研人員、管理人員和學生，在科學研究及相關活動中發生的違反公認的學術準則、違背學術誠信的行為。 第三條 高等學校預防與處理學術不端行為應堅持預防為主、教育與懲戒結合的原則。 第四條 教育部、國務院有關部門和省級教育部門負責制定高等學校學風建設的宏觀政策，指導和監督高等學校學風建設工作，建立健全對所主管高等學校重大學術不端行為的處理機制，建立高校學術不端行為的通報與相關信息公開制度。
學生有學術不端行為的，還應當按照學生管理的相關規定，給予相應的學籍處分。 學術不端行為與獲得學位有直接關聯的，由學位授予單位作暫緩授予學位、不授予學位或者依法撤銷學位等處理。 第三十條 高等學校對學術不端行為作出處理決定，應當制作處理決定書，載明以下內容：
對學術不端的舉報，一般應當以書面方式實名提出，有明確的舉報對象，有實施學術不端行為的事實，并且有客觀的證據材料或者查證線索。 對于舉報的處理，《辦法》嚴格實行正當程序原則，對調查組的組成規則、回避制度、當事人權利義務、調查結論等作出了明確規定。
2021年3月31日，國家自然科學基金委員會公布了2021年學術不端行為案件處理決定。 此次共通報了七個案例，涉及到華北電力大學、青島大學、上海大學、中國醫科大學、南京醫科大學、海南醫學院等多所高校的教師，處罰原因有數據造假、抄襲剽竊、圖片造假、重復發表、署名不實、虛構同行評議意見、論文存在代寫代投、擅標他人基金項目號等。 2021年5月13日至22日，美國生物化學和分子生物學學會旗下期刊《生物化學雜志》（ Journal of Biological Chemistry, JBC ） 陸續撤下了中國工程院院士、生物醫學家曹雪濤名下的12篇論文。 根據 JBC 的撤稿聲明，這12篇論文均由作者發起撤回，絕大多數被期刊認為存在一圖多用或圖像操縱問題。
