1、學術碩士論文查重是全文上傳，格式對檢測結果可能會造成影響（影響很小，不會超過5%），需要將最終交稿格式提交檢測，將影響降到最小，對于3萬字符以上的論文格式的影響是可以忽略的。需要注意的是，一般重復率指的是正文，摘要、目錄、參考文獻只要格式正確檢測系統會自動刪除。此外，段落標題以及圖表標題是會算重復的。至于論文致謝，有人說也要檢測，有人說不用檢測，具體要問導師，不過致謝部分應該沒人會抄襲吧。 2、上傳論文后，系統會自動檢測該論文的章節信息，如果有自動生成的目錄信息，那么系統會將論文按章節分段檢測，否則會自動分段檢測。整篇的結果是用你重的字符數比上你全篇的字符數 每一章節的重復率是用這章重的字符數比上這一章的總字符數
學術論文查重系統 是以章為基本單元的。 比如封面、摘要、緒論都會作為單獨的一章，每一章出一個論文檢測結果，標明重復率。 每一章有單獨的重復率，全文還有一個總的重復率。 有的學校在規定論文是否通過查重時，不僅要求全文重復率不能超過多少，還對每章重復率也有要求，以連續13個字與別的文章重復做為判斷依據的。 所以不能連續超過13字相同，否則就會標紅。 學術查重是以連續13字相似做為依據的，所以只要保證論文中的每一句話都不與他人的內容相似，然后保證任意連續13字都不同，那學術是檢測不出來。
學術檢測報告主要是由全文重復率、去除引用部分重復率以及去除本人發表文獻重復率。 因而，學術檢測自己的文章不會算在重復率里。 但是，這有一個前提條件，即學生在提交自己的文章進行檢測時，已經發表該文章并且該文章被收錄在學術，其著作權歸該學生所有。 同樣的，職稱論文也是同樣的規定，其唯一的區別主要體現在，碩士論文查重系統是學術VIP5.1,而職稱論文查重系統則是AMLC或者SMLC這兩種，但是，凡是作者已經將論文發表并被學術收錄且著作權屬于作者的論文，通常都會在去除本人已發表重復率的計算部分予以體現。 學術重復率檢測主要有3類：1.總復制比；2.去除引用文獻后的復制比；3.去除自引文獻后的復制比。 去除自引就是將你發表的論文排除的，但是要是第一作者，而且你要在碩論中標注出來。
前面說了碩士論文的文獻是不包含在查重范圍內的，學術VIP查重會把論文中的文獻自動去除，所以不會算到正文查重上。 碩士要求的重復率一般不會高于20％，如果大于或者等于20％，小于30％者，疑似存在學術不端行為，取消優秀學位論文評選資格，限期修改進行復檢。 初檢的重復率如果大于或等于30％，之后復檢大于或等于20％者，可能會被取消本次學位論文答辯資格。
