學術參考文獻一般不查重，而且論文的參考文獻是一般是不需要查重的，而且學術檢測系統時，就算把全部的論文上傳上去，學術檢測查重系統也是可以識別正確的目錄和參考文獻并剔除，不參與正文檢測。 但是也千萬不要圖省錢，把參考文獻哪些不參考查重的地方省略了。
論文的撰寫應本著嚴謹、求實的科學態度，凡有引用他人成果之處，均應按論文中所出現的先后次序列于參考文獻中，并且只列出正文中以標注形式引用或參考的有關著作和論文，參考文獻應按正文中出現的順序列出直接引用的主要參考文獻。 一般而言，無論是高校還是雜志社在對論文進行學術查重過程中，主要考慮的是論文的去除引用文獻的重復率部分，這也可以在學術檢測報告當中體現出來，學術報告當中有一個全文的重復率部分，還有一個部分是去除引用文獻的重復率部分，因此，一般而言，即使論文作者對其他論文進行引用，只要引用格式正確，一般都會被學術論文查重軟件自動識別為引用部分，以綠色字體標注，在去除引用文獻部分的重復率會有所體現。
論文引用文獻會查重嗎？ 引用文獻是論文寫作中，對某一研究知識的借鑒，在研究寫作過程中，無法規避需要引用文獻資料。 可是引用文獻也要講究方式的，假如引用不正確，這些內容會被檢測判斷為抄襲。
近些年來，各所高校和研究機構，對于論文學術研究逐漸重視起來，所以使用大部分在論文查重的時候，基本上都是使用學術進行 查重檢測 ，而學術的論文查重數據庫也是目前市面上最權威、專業的，并且也越來越智能。 一般來說不管是高校還是雜志社，在學術系統進行查重檢測的時候，系統能否出去個人引用的內容，學術的檢測報告里面也會展示出來，學術的檢測報告里面有一個全文的重復率部分，還有一部分標綠的是引文的部分，但是這部分也是算進去重復的，要是因為的格式正確，那么這部分就會被學術論文查重系統自動的識別為引文部分。
